不断积累的预报经验使郑媛媛对气象预报有了明晰的思路，此时的她开始了首席预报员的生涯 。2003年6月25日 ，省政府在省气象台主持召开了天气和防汛会商会 ，会上，省气象台发布了汛情预测预报 。当时郑媛媛提出淮河将出现大洪水。大家为之捏了一把汗。淮河自91大水自今，历时十一年 ，几次听到“狼来了” ，洪水真的要来了吗？郑媛媛认真分析预报资料，与中央气象台首席及周边省气象台会商 ，讨论对天气分析意见 ，并肯定了淮河洪水“这条狼要来了 ”的预报结论 。入梅后我省一场场强降水不断发生，一个个洪峰冲击着淮河 。为了做准天气预报 ，郑媛媛在领班期间加班加点工作 ，特别是在王家坝分洪前后，其他两位首席随局领导到防汛一线现场服务 ，她在工作中挑起预报服务的大梁。7月3日王家坝分洪的当天 ，下午4时，周围气象台站 、中央气象台和日本数值预报都没有预报出未来我省有大的降水 ，郑媛媛根据省台开发研制预报系统方法的结果 ，结合自己的预报经验，果断地发布沿淮淮北暴雨警报，24小时内沿淮淮北出现了10站暴雨到特大暴雨的强降水 。7月4日下午 ，她使用6小时雷达滚动降水估测方法对雷达实时资料分析后得出 ，未来6小时滁州等地可能出现内涝 。当天夜晚的5个小时内，滁州就遭遇了特大暴雨。
作为一个预报首席 ，在防汛关键时刻 ，不仅自己要做准预报，同时 ，还要对全省各市气象台站加强技术指导 。郑媛媛通过流媒体广播视频系统 ，与六安 、巢湖等市台站不断联系，通报雨情、汛情 ，听取当地政府部门对气象服务的需求 。并根据雨带位置、雨强强度及时对有关台站进行不同的技术指导 ，对地处平原 、山区的台站需注意的问题，郑媛媛及时提醒他们做好内涝 、洪涝、地质灾害及水库安全的预警预报服务。7月8 、9 、10三天 ，正是淮河安危面临最关键的决择 ，巢湖、大别山区同时强降水集中，汛情紧急 。强烈的责任意识促使郑媛媛不放过每一个天气过程，认真做好每一次预报服务 ，进行每一次有效的预报指导 。省防指根据白湖地区未来将有40～60毫米降水预报 ，电令迅速将白湖东大圩蓄洪区内的人员全部转移至安全地带。当暴雨再次降临白湖时，7000多人正在安全转移 。由于在防汛中做出了突出的成绩 ，安徽省委 、省政府授予郑媛媛同志“2003年全省抗洪抢险先进工作者 ”称号 。
为了做准做好预报服务 ，郑媛媛主动放弃休息，跟随省局领导到地处大别山区的金寨 ，到抗洪一线指导预报工作。当时梅山水库的水位不再继续上涨 ，部分已撤离的群众急于返回住所。金寨县的陈县长非常关心未来的天气 。郑媛媛告诉他们：根据最新气象资料分析，今天夜里金寨县不会有强降水 ，你们可以放心地睡个安稳觉 。顿时 ，陈县长紧张的神情轻松了许多，他当即给县防汛指挥部打电话 ，对工作重新作了部署。亲身的感受让郑媛媛感慨万分 ，她发自内心的说出了这样一段话：我还从未感受过天气预报对领导决策有如此大的影响力，气象预报是政府领导防汛决策的指南针，看来真是毫不为过 。我深深地感到身上的担子更重了 ，责任更大了 。
